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ISSN: 2333-9721

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基于特征模板的条件随机场快速并行计算技术
Feature Template-Based Parallel Computation Technique for Conditional Random Fields
 [PDF]

黄双萍, 苏志良, 岳学军, 邓小玲
Computer Science and Application (CSA) , 2013, DOI: 10.12677/CSA.2013.35043
Abstract:
条件随机场(CRFs)是现今较为流行的一种概率图模型,已经被广泛地应用到自然语言处理、生物计算、计算机视觉等领域当中。在实际应用中,采用基于上下文特征的特征函数创建法往往会产生大规模的特征函数,造成因计算复杂度过大而建模困难,模型无法高效率地训练生成。本文提出一种基于特征模板的快速并行计算技术,通过观察特征模板创建的上下文特征函数主要特点,对M矩阵进行并行处理,降低计算量。实验结果表明,本文提出的快速计算方法较传统方法在速度上有非常大的优势。
Conditional Random Fields (CRFs) is a popular probabilistic graphical model, which has been applied in a wide range of areas, including Natural Language Process (NLP), Bioinformatics, Computer Vision, etc. However, con- textual features-based methods usually lead to large-scale feature functions and result in high computational complexity and low model training efficiency. In this paper, a feature template-based parallel computation technique is proposed to parallelly process M matrix and reduce computational complexity through observing the main feature of contextual feature function created by the template. Experimental results show that our approach significantly outperforms tradi- tional feature function approach on computation speed.
铟锡氧化物纳米粉体的低温溶剂热法制备
邓小玲,陈清清?,孟建新?
无机化学学报 , 2009,
Abstract: 以氯化铟和氯化锡为原料,氨水为沉淀剂,先用化学沉淀法制备了前驱体,然后将该前驱体以乙二醇为溶剂在聚四氟乙烯内衬的反应釜中于低至190℃下反应,获得了铟锡氧化物(ito)纳米粉体。采用扫描电子显微镜(sem)、x射线衍射(xrd)及纳米粒度仪zetasizernano-zs对在不同温度、不同时间下反应的所得的ito纳米粉体进行了表面形貌、结构和粒度分布等分析。结果表明,制备的ito纳米粉体为立方晶相,粉体的平均颗粒小于100nm;与已有的ito纳米粉体制备方法相比,本溶剂热法制备过程无需高温烧结、流程简单,反应过程所需的温度可低至190℃,是迄今为止文献报导制备ito的最低温度,同时所得产物纯度高、粒度均匀、分散性很好。
多特征融合的低景深图像前景提取算法
邓小玲, 倪江群, 李震, 代芬
自动化学报 , 2013, DOI: 10.3724/SP.J.1004.2013.00846
Abstract: ?针对低景深(Lowdepth-of-field,DOF)图像,提出了一种融合纹理、颜色和高阶统计量(Higher-orderstatistics,HOS)特征的聚焦前景提取方法.首先,根据相似性最大化原则,通过迭代获得纹理和颜色特征的优化权重,实现低景深图像的区域分割.然后,根据优化权重值计算颜色空间上的加权HOS值,并结合区域归属前景的划分策略,实现低景深图像的前景提取.实验结果表明,该算法可以同时取得较高的主观和客观评价效果.
重组腺病毒ADV-TK对肝癌抑制作用的实验研究
陈耿臻,韩慧,许铭炎,邓小玲
华西医学 , 2010,
Abstract: 【】目的观察已构建的含胸苷激酶(TK)自杀基因的重组腺病毒(ADV-TK)对肝癌细胞的体外杀伤作用和对肝癌裸鼠移植瘤的治疗效果。方法将ADV-TK体外感染人肝癌细胞株SMMC-7721,噻唑蓝(MTT)法检测受感染的SMMC-7721细胞被不同浓度更昔洛韦(GCV)作用后的细胞存活率情况。构建肝癌SMMC-7721裸鼠移植瘤模型,观察肿瘤注射重组腺病毒ADV-TK结合GCV治疗移植瘤的变化。结果相同滴度的重组腺病毒与不同浓度的GCV作用于肝癌细胞株SMMC-7721后,MTT法检测到细胞的存活率随着GCV浓度的增加而不断降低。动物实验中ADV-TK治疗组肿瘤体积明显小于对照组(ADV-null及NS)(P<0.01)。结论重组腺病毒ADV-TK对肝癌SMMC-7721细胞的体外增殖和裸鼠体内的移植瘤生长均有明显的抑制作用。【Abstract】ObjectiveToexploretheinhibitoryeffectofrecombinantadenoviruscontainingTKgene(ADV-TK)ontransfectedhumanlivercancercellsSMMC-7721invitroandmurinetransplantedhepatocarcinomainvivo.MethodsSMMC-7721cellstransfectedwithADV-TKwereexposedtomediumwithGCV.ThecellviabilitywasmeasuredbyMTTassays.IntheestablishedmodelofSMMC-7721humanlivercancer,nudemiceunderwentintratumoralinjectionwith1109pfuADV-TK,thecontrolvector(ADV-null)ornormalsaline(NS)andagain7dayslater,twiceforall.GCVwasgivenatadoseofl00mg/(kg?d)onthefollowingdayofinjectionfor10days.Thetumorinhibitoryeffectwasobservedbymeasuringthetumorsizes.ResultsAftertransfectedbyADV-TKinvitro,andcombinedwithGCV,thecellgrowthofSMMC-7721cellweresignificantlysuppressed.Theresultofinvivoassayshowedthattumorvolumesintreatmentgroupwereapparentlysmallerthanthatinthecontrolgroup(P<0.01).ConclusionRecombinantadenoviruscombinedwithGCVshowsasignificantinhibitoryeffectonSMMC-7721cellsinvitroandmurinetransplantedhepatocarcinomainvivo.
基于高光谱成像技术的柑橘黄龙病病情诊断及分类
邓小玲,郑建宝?,梅慧兰?
西北农林科技大学学报(自然科学版) , 2013,
Abstract: 【目的】柑橘黄龙病(citrushuanglongbing,hlb)是一种无法根治且易扩散的病害,建立柑橘黄龙病病情诊断及分类的方法,以及时发现并去除病株,防止感染其他果树。【方法】基于高光谱成像技术,利用最小噪声分离变换进行降维去噪、像元纯净指数获取纯净像元并建立训练集,通过fisher判别法对柑橘黄龙病病情进行鉴别并分类。【结果】通过对训练集设置适当的门限值,柑橘黄龙病病情识别正确率达90%以上。【结论】利用高光谱技术进行柑橘黄龙病病情诊断具有较高的可行性。
?重组腺病毒adv-tk基因的构建及其对肝癌细胞的杀伤作用
?陈耿臻,韩慧,许铭炎,邓小玲
南方医科大学学报 , 2010,
Abstract:
牡蛎中诺如病毒核酸两种提取方法比较
袁巧,李晖,邓小玲,莫艳玲,方苓,柯昌文
南方医科大学学报 , 2013,
Abstract: 目的寻找简便有效的更适合长期监测的牡蛎中诺如病毒核酸提取的方法。方法通过甘氨酸聚乙二醇富集后硅胶膜离心柱法(方法a)和蛋白酶k生物消化后顺磁性硅胶基法(方法b)两种核酸提取方法,采用实时rt-pcr检测自然状态的牡蛎和人工染毒状态的牡蛎来进行比较。结果两种方法的阳性检出率没有差异,总体比较方法b的病毒回收率高。结论方法b优于方法a,且方法b更快捷,故方法b更适合长期监测。
pkc介导凝血酶诱导人肺成纤维细胞单核细胞趋化蛋白-1的表达
袁超,许铭炎,陈耿臻,傅玉才,邓小玲
南方医科大学学报 , 2012,
Abstract: 摘要:目的研究蛋白激酶c(pkc)在凝血酶诱导人肺成纤维细胞(hlf-1)单核细胞趋化蛋白-1(mcp-1)表达信号通路中的作用。方法分别用几种不同类型的pkc抑制剂预处理hlf-1,再用凝血酶(10nmol/l)刺激hlf-1,利用elisa法检测上清液中mcp-1的蛋白表达;提取细胞裂解液中总rna并逆转录合成cdna,利用实时荧光定量pcr检测mcp-1mrna表达水平。结果广谱型pkc抑制剂bisindolylmaleimidei和ro-31-8220可抑制凝血酶诱导的hlf-1mcp-1蛋白释放及mrna表达,而ca2+依赖性pkc抑制剂g?6976则没有抑制效果。结论非ca2+依赖性pkc介导凝血酶诱导hlf-1释放mcp-1。
整合素αvβ6和junb在口腔鳞癌组织中的表达及其临床意义
方少斌,邓小玲,陈筠,陈永辉,许铭炎
癌变·畸变·突变 , 2015,
Abstract: ?目的:探讨整合素αvβ6、junb在口腔鳞癌组织中的表达及其临床意义。方法:采用免疫组化方法检测120例口腔鳞癌及15例口腔正常黏膜组织中整合素αvβ6和junb的表达情况,并分析两者表达与口腔鳞癌患者临床病理指标及预后的关系。结果:整合素αvβ6表达于口腔鳞癌组织的细胞质和胞膜,而junb定位在口腔鳞癌组织和口腔正常黏膜组织的细胞核内。整合素αvβ6、junb在口腔鳞癌组织中的表达强度显著高于口腔正常黏膜组织(p<0.01)。整合素αvβ6在口腔鳞癌组织中的表达与浸润深度(t分期)、组织分化程度、是否有淋巴结转移(n分期)密切相关(p<0.05),而junb在口腔鳞癌组织中的表达与浸润深度、是否有淋巴结转移密切相关(p<0.05)。单因素生存分析表明,整合素αvβ6高表达患者的预后较低表达的患者差(p=0.021)。cox回归多因素分析表明是否有淋巴结转移是影响患者预后的独立危险因素(p<0.05)。结论:整合素αvβ6和junb在口腔鳞癌组织中表达增加,并与口腔鳞癌的浸润、转移密切相关;整合素αvβ6表达可作为判断口腔鳞癌患者预后判断的指标。
tgf-β及egf信号对溶血磷脂酸诱导口腔鳞癌细胞增殖的影响
周小琼,邓小玲,*傅玉才,许铭炎,*
癌变·畸变·突变 , 2014,
Abstract: ??目的:?探讨转化生长因子?(tgf)及表皮生长因子?(egf)信号对溶血磷脂酸?(lpa)诱导口腔鳞癌细胞增殖的影响。方法:口腔鳞癌sas细胞接种于96孔板中,以含不同浓度?(0、1、5和10?μmol/l)lpa的无血清dmem分别处理细胞24和48?h后采用cck-8法检测细胞增殖;免疫印迹检测10?μmol/l?lpa分别处理细胞0、0.5、2和4?h后对tgf-β下游信号分子smad2的影响;应用不同浓度?(10、20和50?μg/ml)的tgf-β阻断抗体1d11和100?nmol/l?egfr?阻断剂ag1478分别预孵育细胞2和4?h后,再加入lpa诱导,检测sas细胞增殖情况。结果:lpa呈剂量效应和时间效应诱导sas细胞增殖,lpa浓度增加到10?μmol/l时sas细胞数是对照组的近1.7倍?(p<0.01),细胞在lpa处理24?h后增殖速率较对照组增加22%?(p<0.05)。lpa可活化tgf-β,但tgf-β阻断抗体1d11并不能阻断lpa诱导的sas增殖;相反,egfr阻断剂ag1478能够抑制lpa诱导的sas增殖,抑制率达到近77%。结论:lpa诱导的口腔鳞癌sas细胞的增殖与egfr活化信号有关,而与lpa诱导的tgf-β活化无关。
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